甲賀の地には甲賀流忍術が伝わっており、忍術の極意書には忍者たちが薬草を育て、独自で加工しさまざまな薬を生み出していたことが記されています。

忍者はそれらを持ち歩き、さらに修験者による薬の配布や宿場町等で販売された街道売薬、全国を廻商する近江商人などにより、滋賀の薬は、全国に広まりました。

やがて滋賀は甲賀・日野を中心に、富山・奈良と並ぶ三大配置薬生産県として発展。今日では薬機法に基づく近代的な設備のもと、科学の粋を結集した企業が多様な医薬品を製造しています。

2010年には甲賀市が「くすり学習館」をオープンし、展示や体験を通して人と薬の関わりを学べる場を提供しています。